洱源野生动植物资源多样性特点突出。现存蕨类以上高等植物700多种，种子植物的15个地理成分齐全，有国家级珍稀濒危植物11种（一类1种，二类10种）。在主要森林植被类型中，针叶林地域分布最广，常见树种分属43科、95属、249种。鸟类有上百种。罗坪山至点苍山一线及西部广大山区是候鸟迁徙的重要通道，其中久负盛名的鸟吊山，候鸟南迁时节，百鸟翔集，蔚为壮观。境内有国家重点保护的野生动物22种，其中一类的有金钱豹和黑鹿两种。中草药材品种多、蕴藏量大，植物类达860多种，动物类也有10余种。花卉资源中，兰科植物约有16属、120余种，分别占全国的10%和12%，是全国闻名的“兰花之乡”。

    洱源坝区主产稻谷、蚕豆、烤烟、油菜、大蒜及各种水产品，被誉为“鱼米之乡”。早熟大蒜个头大、色泽好、食味香，富含多种维生素，倍受中外客商青睐。水草丰茂，饲料充足，乳牛饲养历史悠久，是全国著名的“乳牛之乡”。山区土地广袤，牧草丰盛，主产玉米、薯类和杂粮，林果和畜牧业的发展极具潜力。境内所产鲜梅个大肉厚质优，种植、加工、销售相连接的梅子产业已经崛起，洱源已成为名符其实的“梅果之乡”。传统名特产品邓川乳扇、凤羽砚台等享誉省内外。

    洱源素有“高原水乡” 之称，水资源极为丰富。西部黑潓江水系是澜沧江的主要源流之一，东部弥苴河水系由弥茨河、凤羽河、海尾河、弥苴河、罗时江、永安江等6条河流，以及与之连通的海西海、茈碧湖、西湖、东湖4个湖泊组成，水流南注洱海，多年平均径流量4.82亿立方米，占洱海多年平均径流量8.13亿立方米的60%，洱源因之被称为洱海之源。

    洱源地处滇西高温热水区，地热资源得天独厚，是闻名遐迩的“温泉之乡”。境内分布有九台——玉湖、牛街——三营、下山口——城西——温水等地热主显示区，共有30余处自然出露点，水温在30～90℃，矿物质含量均达医疗热矿水标准。近年来，以大理地热国和下山口温泉度假村为主的温泉休闲旅游不断升温，开发力度正在加大。

洱源境内已发现矿种25个，已知矿产地50余处。金属矿有金、银、铅、锑、铜、锌、钨、锰、铁、钛、镁、铝等，尤以钛矿储量丰富、品位高、杂质低、不含有害元素。非金属矿主要有岩盐、硅藻土、大理石、石灰石、褐煤、泥炭（草煤），尤以建筑石材储量大、品质优。